Escribió una treintena de novelas y diecisiete volúmenes de historias cortas. También hizo críticas literarias y estudios y novelas históricas, además de biografías de presidentes norteamericanos como Woodrow Wilson y Theodore Roosevelt. En 1974 redactó sus propias memorias: A writer´s capital.

Se interesó por la conciencia de clase de la gente más adinerada del país más rico del mundo, por los efectos del dinero sobre la moral, los principios y los valores. Siguió el consejo que el escritor y crítico literario Henry James ofreció a la escritora y diseñadora estadounidense Edith Wharton: "Haz Nueva York. La versión de primera mano es preciosa". Así, con sus muchas historias, documentó un mundo del cual era partícipe. No pretendía ensalzar las clases altas, sino entenderlas y proyectar la comprensión de su modus vivendi. Defendía el derecho de los privilegiados a ser feliz, así como el esfuerzo que significaba mantener sus fortunas a flote. A su vez, era crítico y tenía un profundo interés en traspasar la superficialidad de describir el dinero y los hábitos de los adinerados. Llegó a retratar una generación de la clase alta neoyorquina, siendo el cronista de sus actos y valores, un espectador con gran ambición moral.

Su primera novela, The indifferent children (1947), fue publicada bajo el seudónimo de Andrew Lee, debido a la presión de sus padres, que menospreciaban sus aptitudes literarias y temían que su obra le repercutiese en el ejercicio de la abogacía. Sin embargo, pronto empezó a escribir historias cortas en periódicos de prestigio con su nombre real.

En 1964 publicó El rector de Justin,  su novela más reconocida tanto por la crítica como por el público, que además fue finalista del National Book Award y estuvo nominada al premio Pulitzer.

Su último libro, The last of the old guard (2008) muestra su aversión a los cambios y ratifica su conocido puritanismo. Su prosa moralista se basaba en una gran eficacia discursiva y sobriedad estilística.

Auchincloss completaba su intensa vida laboral con un gran afán por la familia y por la vida pública. Fue presidente de la Academia Americana de las Artes y Letras, así como del Museo de la Ciudad de Nueva York. En el 2005, George Bush le otorgó la medalla nacional de las Artes.